Diversité spécifique chez les Helminthes de bovins : méthodes d'approches et facteurs de variations

Abstract

La diversité helminthique des ruminants a été peu étudiée, surtout dans le cadre d'études faunistiques. Seules 5 ¿L 6 espéces de nématodes parasitent le tube digestif des bovins en régions tempérées. La diversité spécifique est estimée suí les vers adultes récoltés aprés autopsiee t la diversité génériqueá partir de des larvesi nfestantesd ans les matiéresf ecales. Chezl es nématodest,a nt á large (France,C olombie,U SA, Espagne,Z aire, Argentine,B résil) qu'á petite échelle (Pampas d'Argentine) nous avons montíé que la diversité était associée á de faibles intensités. Dans ces études nous avons utilisés I'indice classique de Shannon, de qualité incertaine en I'absence de mesure formelle de sa variabilité. Il y avait nécessité de développer des méthodes plus efficaces pour différencier des sites ou des fermes. Nous avons développé une méthode fondée sur les résultats d'autopsie parasitaire: une analyse discriminante était établie sur les proportions de chaque espéce, sur les proportions rangées par ordre décroissant (distribution de ces proportions), et enfin sur une combinaison linéaire de 15 indices univariés (correspondant á une opposition dominance-diversité). Cette technique statistique a été utilisée ensuite pour apprécier la diversité générique obtenue á partir des larves infestantes obtenues lors de coprocultures. Cette dernidre facon de procéder a été efficace pour differencier les fermes selon leur diversité générique, était répétable, et nous I'avons choisie comme méthode de référence. Une étude a alors été réalisée dans 21 fermes des Pampas Argentines afin de rechercher les facteurs de variation de la diversité. Sur le modéle de la théorie des iles, nous avons recherché si le nombre d'hótes infestés introduits et de traitements anthelminthiques (fréquence et tlpe) limitant la survie des nématodes au sein des fermes, étaient des facteur importants du maintien de la diversité. L'augmentation du nombre de traitements réduit fortement la diversité générique. Des recherches complémentaires seraient á efectuer en ce qui concerne I'utilisation de la diversité fonctionneles plutót que de la diversité spécifique ou générique.

Helminth diversity has been poorly studied in ruminants and faunistic studies were mostly undertaken for diagnostic purposes. Cattle infection is limited to five or six species of nematodes under temperate climates. Species diversity is usually estimated on adults worms after necropsy and generic diversity on infective larve in faecal cultures. Diversity in free living organisms has been associated to stability of infestation, thus to possibly low infections. In cattle nematodes at large scale (data from France, Spain, Zaie, USA, Columbia, Argentina, and Brazil) or at local scale (Argentina Pampas) diversity was associated to low intensity. In these previous studies we used Shannon classical index, and the quality of this index is questionnable as no formal knowledge on its variability is available. We had the need to develop indices or methods that discriminate best between sites or farms. We developped a method based on necropsy data in cattle and sheep: discriminant analysis was performed on species proportions (species characteization) , proportions arranged in decreasing order (distribution of proportions) , or a combination of 15 univariate indices used in ecology (dominance versus diversity. This statistical technique was then used on genera diversity data easily obtained from infective larvae collected from faecal cultures. The latter method was also efficient ot discriminate between sites, was repeatable and then was chosen as our reference method. A study was undertaken in 21 farms in Argentina Pampas in order to identify the factors of variation of diversity. In correspondance to an island equilibrium model, the number of infected host introduction and anthelmintic treatments (number and types) eg the survival in farm, were the principal factors evaluated. The role of anthelmintic treatment was very important as it clearly decreased the genera diversity. Further investigations are required to determine whether functional diversity rather than species or genera diversity should be studied.