Estudio mediante dinámica molecular de la estructura y dinámica del agua

Abstract

Estudiamos las características estructurales y dinámicas del agua utilizando el método de dinámica molecular con el modelo Simple Point Charge-Extended (SPC/E). Para ello realizamos simulaciones a densidades constantes en el rango 0,65 - 1 g/cm3 a diferentes temperaturas (entre 215 K y 360 K) utilizando el paquete de simulación GROMACS. Caracterizamos la estructura del sistema utilizando las funciones de distribución radial de oxígenos y de distribución de puentes de hidrógeno, mientras que para analizar las propiedades dinámicas estudiamos el comportamiento de la función de correlación de puentes de hidrógeno histórico-dependiente. Este análisis nos permite caracterizar las relaciones entre la estructura y la dinámica del sistema simulado y su variación con la modificación de la densidad.